Критический момент для НДС: Вы имеете право на вычет НДС только после того, как товар оприходован (есть ДТ) и факт уплаты НДС в бюджет подтвержден (есть Отчет брокера и платежки).
Совет Дмитрия: Внимательно проверяйте УПД от вашего ВЭД-агента. В нем должно быть четко указано, какая часть оплаты — НДС с услуг агента (20%), а какая — таможенные платежи. Это исключит путаницу в бухгалтерских проводках.